MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Metallosphaera sedula DSM 5348 chromosome

Total Repeats: 38750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009440	GCT	2	6	139522	139527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302957
2502	NC_009440	TAA	2	6	139538	139543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302957
2503	NC_009440	AAG	2	6	139564	139569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302957
2504	NC_009440	AGA	2	6	139618	139623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302957
2505	NC_009440	AAT	2	6	139626	139631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302957
2506	NC_009440	TCA	2	6	139703	139708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302957
2507	NC_009440	CAA	2	6	139723	139728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	146302957
2508	NC_009440	GTT	2	6	139761	139766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302958
2509	NC_009440	TGGC	2	8	139767	139774	0 %	25 %	50 %	25 %	146302958
2510	NC_009440	GAAG	2	8	139795	139802	50 %	0 %	50 %	0 %	146302958
2511	NC_009440	CTT	2	6	139842	139847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302958
2512	NC_009440	GAA	2	6	139931	139936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302958
2513	NC_009440	AGG	2	6	139948	139953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302958
2514	NC_009440	GTT	2	6	140130	140135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302959
2515	NC_009440	GGA	2	6	140139	140144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302959
2516	NC_009440	AGG	2	6	140156	140161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302959
2517	NC_009440	AGC	2	6	140318	140323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302959
2518	NC_009440	TTC	2	6	140430	140435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302959
2519	NC_009440	TCT	2	6	140448	140453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302959
2520	NC_009440	CCCCA	2	10	140477	140486	20 %	0 %	0 %	80 %	146302959
2521	NC_009440	GAA	2	6	140541	140546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302959
2522	NC_009440	GGT	2	6	140613	140618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302959
2523	NC_009440	GTA	2	6	140634	140639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302959
2524	NC_009440	CT	3	6	140968	140973	0 %	50 %	0 %	50 %	146302959
2525	NC_009440	GTT	2	6	141017	141022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302959
2526	NC_009440	TTA	3	9	141077	141085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_009440	CCT	2	6	141142	141147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2528	NC_009440	GA	3	6	141241	141246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_009440	CT	3	6	141250	141255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2530	NC_009440	GTGG	2	8	141271	141278	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_009440	ATC	2	6	141339	141344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_009440	ATTTC	2	10	141745	141754	20 %	60 %	0 %	20 %	146302960
2533	NC_009440	GTT	2	6	141843	141848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302960
2534	NC_009440	TA	3	6	141881	141886	50 %	50 %	0 %	0 %	146302960
2535	NC_009440	TCT	2	6	141906	141911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302960
2536	NC_009440	CTT	2	6	141931	141936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302960
2537	NC_009440	AGGA	2	8	142069	142076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_009440	AAG	2	6	142083	142088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302961
2539	NC_009440	CTC	2	6	142141	142146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302961
2540	NC_009440	TCC	2	6	142184	142189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302961
2541	NC_009440	ATT	2	6	142208	142213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302961
2542	NC_009440	CTTT	2	8	142302	142309	0 %	75 %	0 %	25 %	146302961
2543	NC_009440	TAAA	2	8	142357	142364	75 %	25 %	0 %	0 %	146302961
2544	NC_009440	CTA	2	6	142398	142403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302961
2545	NC_009440	CTA	2	6	142430	142435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302961
2546	NC_009440	AAGT	2	8	142507	142514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_009440	GCG	2	6	142578	142583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_009440	CGG	2	6	142617	142622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_009440	GA	3	6	142663	142668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_009440	AG	3	6	142698	142703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_009440	GT	3	6	142809	142814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_009440	ATA	2	6	142881	142886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_009440	AGA	2	6	142897	142902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302962
2554	NC_009440	TTAT	2	8	142907	142914	25 %	75 %	0 %	0 %	146302962
2555	NC_009440	TCT	2	6	142922	142927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302962
2556	NC_009440	CCT	2	6	142934	142939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302962
2557	NC_009440	AGC	2	6	142947	142952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302962
2558	NC_009440	ATA	2	6	143029	143034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302962
2559	NC_009440	CTT	2	6	143077	143082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302962
2560	NC_009440	TAA	2	6	143090	143095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302962
2561	NC_009440	CTC	2	6	143101	143106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302962
2562	NC_009440	TTC	2	6	143116	143121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302962
2563	NC_009440	CTTCT	2	10	143122	143131	0 %	60 %	0 %	40 %	146302962
2564	NC_009440	GGA	2	6	143233	143238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302962
2565	NC_009440	AAT	2	6	143371	143376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302962
2566	NC_009440	TAA	2	6	143405	143410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146302962
2567	NC_009440	GGTAT	2	10	143423	143432	20 %	40 %	40 %	0 %	146302963
2568	NC_009440	CCT	2	6	143446	143451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302963
2569	NC_009440	CGT	2	6	143453	143458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302963
2570	NC_009440	TGA	2	6	143608	143613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302963
2571	NC_009440	CTTTCA	2	12	143617	143628	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	146302963
2572	NC_009440	TGG	2	6	143674	143679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302963
2573	NC_009440	TTC	2	6	143760	143765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302963
2574	NC_009440	AGG	2	6	143769	143774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302963
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2576	NC_009440	GTT	2	6	143946	143951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302963
2577	NC_009440	TAG	2	6	144015	144020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302964
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2579	NC_009440	GA	3	6	144116	144121	50 %	0 %	50 %	0 %	146302964
2580	NC_009440	CCG	2	6	144141	144146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146302964
2581	NC_009440	CCA	2	6	144177	144182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302964
2582	NC_009440	TCA	2	6	144217	144222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302964
2583	NC_009440	TTC	2	6	144275	144280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302964
2584	NC_009440	CGA	2	6	144355	144360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302964
2585	NC_009440	CGA	3	9	144376	144384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302964
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2587	NC_009440	GGA	2	6	144520	144525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302964
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2589	NC_009440	AG	3	6	144635	144640	50 %	0 %	50 %	0 %	146302964
2590	NC_009440	ACC	2	6	144683	144688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302964
2591	NC_009440	AAG	2	6	144707	144712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302964
2592	NC_009440	TGA	2	6	144766	144771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302964
2593	NC_009440	ACTGA	2	10	144809	144818	40 %	20 %	20 %	20 %	146302964
2594	NC_009440	GA	3	6	144821	144826	50 %	0 %	50 %	0 %	146302964
2595	NC_009440	AGA	2	6	144852	144857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302964
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2598	NC_009440	TGG	2	6	145109	145114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302965
2599	NC_009440	GAA	2	6	145158	145163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302965
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2601	NC_009440	CCAA	2	8	145252	145259	50 %	0 %	0 %	50 %	146302965
2602	NC_009440	ACT	2	6	145281	145286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302965
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2604	NC_009440	TCT	2	6	145488	145493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302965
2605	NC_009440	GGT	2	6	145552	145557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146302965
2606	NC_009440	TCT	2	6	145562	145567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302965
2607	NC_009440	CCT	2	6	145571	145576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146302965
2608	NC_009440	TTA	2	6	145582	145587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	146302965
2609	NC_009440	TAG	2	6	145640	145645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302965
2610	NC_009440	ATT	2	6	145765	145770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_009440	GTG	2	6	145777	145782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_009440	TAG	2	6	145785	145790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_009440	CCA	2	6	145889	145894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146302966
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2616	NC_009440	ACT	2	6	146166	146171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_009440	GAG	2	6	146195	146200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_009440	TCT	2	6	146215	146220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_009440	GTA	2	6	146224	146229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_009440	GAA	2	6	146338	146343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_009440	AGA	2	6	146433	146438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_009440	GGTAA	2	10	146519	146528	40 %	20 %	40 %	0 %	146302967
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2624	NC_009440	CATTT	2	10	146571	146580	20 %	60 %	0 %	20 %	146302967
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2749	NC_009440	TTC	2	6	154039	154044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302975
2750	NC_009440	GAA	2	6	154058	154063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302975
2751	NC_009440	GAC	2	6	154107	154112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146302975
2752	NC_009440	GTT	2	6	154145	154150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	146302975
2753	NC_009440	CTG	2	6	154234	154239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302975
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2755	NC_009440	GTC	2	6	154314	154319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146302975
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2775	NC_009440	GA	3	6	155549	155554	50 %	0 %	50 %	0 %	146302976
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2782	NC_009440	CATGA	2	10	156209	156218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2783	NC_009440	ATC	2	6	156310	156315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146302978
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2855	NC_009440	G	6	6	160996	161001	0 %	0 %	100 %	0 %	146302982
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2862	NC_009440	AGGT	2	8	161359	161366	25 %	25 %	50 %	0 %	146302982
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2868	NC_009440	CCCA	2	8	161737	161744	25 %	0 %	0 %	75 %	146302983
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2985	NC_009440	TAAGGC	2	12	168089	168100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	146302990
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2987	NC_009440	TA	3	6	168326	168331	50 %	50 %	0 %	0 %	146302990
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2990	NC_009440	CATC	2	8	168607	168614	25 %	25 %	0 %	50 %	146302990
2991	NC_009440	AG	3	6	168628	168633	50 %	0 %	50 %	0 %	146302990
2992	NC_009440	GAG	2	6	168642	168647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302990
2993	NC_009440	GAT	2	6	168693	168698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146302990
2994	NC_009440	ACTG	2	8	168759	168766	25 %	25 %	25 %	25 %	146302990
2995	NC_009440	GA	3	6	168800	168805	50 %	0 %	50 %	0 %	146302990
2996	NC_009440	TTC	2	6	168945	168950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146302990
2997	NC_009440	AGG	2	6	169045	169050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146302990
2998	NC_009440	AAG	2	6	169071	169076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146302990
2999	NC_009440	AG	3	6	169464	169469	50 %	0 %	50 %	0 %	146302991
3000	NC_009440	CTCAA	2	10	169486	169495	40 %	20 %	0 %	40 %	146302991

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